强基计划和原自主招生有主要在选拔定位、招生专业、入围校考依据、录取方式四方面有区别。“强基计划”的实施，不仅会优化高中育人方式，也促使高校培养人才的优化。高校若想得到优秀的生源，必然要在管理制度、培养方案、等方面更加完善。此次的改革，更加公平、公正、科学，是利国利民的科教育人机制。
强基计划和自主招生的具体区别
一、选拔定位不同
1、自主招生
自主招生主要选拔“具有学科特长和创新潜质的学生”。
2、强基计划
强基计划主要选拔“有志于服务国家重大战略需求且综合素质优秀或基础学科拔尖的学生”。即将选拔两类群体，主体是高考成绩优异的学生 ，另外是少数在某个领域具有突出才能的“偏才怪才”。
二、招生专业不同
1、自主招生
自主招生没有限定高校招生专业范围。
2、强基计划
强基计划突出基础学科的支撑引领作用，由有关高校结合自身办学特色，重点在数学、物理、化学、生物及历史、哲学、古文字学等相关专业安排招生。
三、入围高校考的依据不同
1、自主招生
自主招生入围高校依据主要是考生的申请材料，申请条件就是奖项。
2、强基计划
强基计划的入围高校依据主要是考生高考成绩，极少数在相关学科领域具有突出才能和表现的考生，有关高校可制定破格入围高校考核的条件和办法，并提前向社会公布。
四、录取方式不同
1、自主招生
自主招生采取降分录取的方式，最低可降至一本线。
2、强基计划
强基计划将考生高考成绩（不低于85%）、高校综合考核结果和综合素质评价等折算成综合成绩，从高到低顺序录取，体现对学生更加全面的考查。
五、培养模式不同
1、自主招生
相关高校对自主招生录取的学生在培养方式上没有特殊安排。
2、强基计划
强基计划录取的学生将实行小班化、导师制，并探索本—硕—博衔接的培养模式，畅通学生成长发展通道，实现招生培养良性互动。
