二本和独立学院进行比较，相对来说还是二本好一些。二本大学分数线要比独立学院高，学费和其他费用上也比独立学院低，师资力量和基础设施配备上也会比独立学院要好一些。
二本大多数是“公办范畴”的，但有极少数也属于“民办范畴”的；“独立学院”多数为“民办范畴”。公办的一般都会有大量的经费、预算等，所以二本学费相对独立学院来说会稍少一些。
独立学院是指实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合作，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校，因而独立学院学费是公立大学的三到四倍。
独立学院是民办高等教育的重要组成部分，属于公益性事业，依法享有民办教育促进法、民办教育促进法实施条例规定的各项奖励与扶持政策；由省、自治区、直辖市人民政府教育行政部门主管本行政区域内的独立学院工作。
