华中科技大学王牌专业主要有机械工程、光学工程、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、控制科学与工程、生物医学工程等。
国家级重点学科
一级学科国家重点学科（7个）
机械工程、光学工程、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、电气工程、控制科学与工程、生物医学工程
二级学科国家重点学科（内科学、外科学按三级）（15个）
西方经济学、高等教育学、生物物理学、微电子学与固体电子学、计算机系统结构、水利水电工程、病理学与病理生理学、内科学（心血管病）、内科学（血液病）、内科学（呼吸系病）、外科学（普外）、外科学（泌尿外）、妇产科学、麻醉学、劳动卫生与环境卫生学
国家重点（培育）学科（7个）
通信与信息系统、内科学（传染病）、影像医学与核医学、儿少卫生与妇幼保健学、中西医结合基础、药理学、管理科学与工程
华中科技大学第四轮学科评估
华中科技大学第四轮学科评估44个学科参评，全部上榜。14个学科进入A类，其中机械工程、光学工程、生物医学工程、公共卫生与预防医学4个学科进入A+；28个学科进入B类，其中19个进入B+。
A+档4个学科：机械工程、光学工程、生物医学工程、公共卫生与预防医学。
A档3个学科：新闻传播学、电气工程、计算机科学与技术。
A-档7个学科：物理学、生物学、控制科学与工程、临床医学、公共管理、工商管理、动力工程及工程热物理。