深圳大学最好的王牌专业有计算机专业、建筑学专业、土木工程专业、光学工程专业、生物医学工程专业以及信息与通信工程等专业。
深圳大学最擅长的是工学相关专业，计算机、建筑学、土木工程、光学工程、生物医学工程、信息与通信工程都不错，除了工学之外，人文社科类的新闻传媒、经济学、法学也都不错的。
国家级特色专业建设点：电子信息工程、建筑学、工商管理、计算机科学与技术、金融学。
省级特色专业建设点：电子信息工程、建筑学、工商管理、计算机科学与技术、金融学，生物技术、法学、广告学、光信息科学与技术、自动化。
省级重点学科：光学工程、政治经济学、国际法学、文艺学、传播学、光学、细胞生物学、材料物理与化学、通信与信息系统、信号与信息处理、建筑设计及其理论、结构工程。